东北师范大学日本研究所是我国成立最早的专门研究日本问题的机构之一。50年代，经国家教育部批准，于历史系成立日本历史研究室；60年代,又于政治教育系、中文系、教育系分别成立了日本政治、日本经济、日本文学、日本教育研究室。在此基础上，1975年经国家教育部批准，将上述各研究室联合起来，又吸收了外语系的苏联研究室，合并组成外国问题研究所
70年代，东北师范大学的外国研究飞跃发展，1979年日本教育研究室扩大为外国教育比较研究所，成为独立研究机构；苏联研究室扩大为苏联研究所。此后，外国问题研究所变成研究日本的专门机构，改名为日本研究所。
所内设有日本经济，日本政治，日本文学，日本历史等四个研究室和稻盛和夫经营哲学研究中心。
日本研究所现有专职研究员12人（其中教授4人，博士生导师一人）。在从事日本研究的同时，还承担着培养日本研究人员的任务，招收硕士研究生和博士研究生。我所的日本政治、日本经济、日本历史、日语语言文学等专业均有硕士学位授予权。其中日语语言文学专业拥有博士学位授予权。
我所资料室成立于50年代，是国内日本研究机构中创建最早的专门藏存日文图书的资料室，现藏日文图书3万余册和多种日文杂志，特别是日本史图书种类在全国位居前列。
日本研究所主办的《日本学论坛》学术季刊在国内外公开发行，具有相当大的影响力。其最初的前身为《日本情况》，1980年改为《外国问题研究》，1999年更名为《日本学论坛》。总计发行了164期，为我国日本学研究作出了重要贡献。
日本研究所成立以来，成果颇丰。1990年以来，共计出版学术专著20余部，发表论文1200余篇。1992年，在国家教委直属院校域外境外研究机构的评估中，我所名列第一名。1995年，在日本国际交流基金的支持下，日本研究所举办了[战后日本50年国际研讨会]，日本政治、经济、文化、文学、哲学等专业的国内外知名专家学者发表了具有高水准的学术论文，在国内外引起很大反响。2001年10月25日，日本京都陶瓷公司无偿捐赠17万美金，在我所成立了“稻盛和夫经营哲学研究中心”并增设“稻盛和夫经营哲学”研究专业，开展日本经济以及经营哲学的研究，已先后发表了数十篇论文和出版了多部研究专著。
日本研究所作为东北师范大学人文学科的主要研究机构正在向着更加辉煌的明天迈进。